Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE6HQ13956 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms