Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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