Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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