Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SRSF6Q13247 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms