Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTP4A2Q12974 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTP4A2Q12974 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTP4A2Q12974 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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