Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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