Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SF3B2Q13435 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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