Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TCOF1Q13428 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TCOF1Q13428 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms