Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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