Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms