Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Speer3W4VSP1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms