Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc166S4R181 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms