Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac5Q9Z2V6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac5Q9Z2V6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms