Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd1Q9Z2E2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms