Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1bQ9Z2C6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1bQ9Z2C6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms