Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ube2aQ9Z255 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ube2aQ9Z255 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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