Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms