Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms