Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms