Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup160Q9Z0W3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms