Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Stxbp4Q9WV89 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms