Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV56

Gdf2, Growth/differentiation factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf2Q9WV56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf2Q9WV56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms