Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam50aQ9WV03 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam50aQ9WV03 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms