Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scnn1gQ9WU39 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Scnn1gQ9WU39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnn1gQ9WU39 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Scnn1gQ9WU39 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms