Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn4Q9WU22 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms