Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms