Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms