Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc2Q9R244 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms