Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hic1Q9R1Y5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms