Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slit2Q9R1B9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slit2Q9R1B9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms