Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Htra1Q9R118 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htra1Q9R118 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htra1Q9R118 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms