Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms