Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms