Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Fhl3Q9R059 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Fhl3Q9R059 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fhl3Q9R059 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fhl3Q9R059 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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