Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col4a4Q9QZR9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col4a4Q9QZR9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms