Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gpc1Q9QZF2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gpc1Q9QZF2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gpc1Q9QZF2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gpc1Q9QZF2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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