Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnnt3Q9QZ47 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms