Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms