Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clic4Q9QYB1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms