Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx4Q9QY61 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms