Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nphp1Q9QY53 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nphp1Q9QY53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms