Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slco1a1Q9QXZ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1a1Q9QXZ6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms