Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms