Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Limd1Q9QXD8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Limd1Q9QXD8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms