Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3a1Q9QX15 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms