Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms