Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdc42ep4Q9JM96 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms