Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rabgef1Q9JM13 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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