Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Higd1aQ9JLR9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Higd1aQ9JLR9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd1aQ9JLR9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Higd1aQ9JLR9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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