Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms